Científicos crean en Brasil el primer banco de datos genómicos de bacterias multirresistentes
La plataforma de acceso abierto desarrollada por un grupo de investigadores de la Universidad de São Paulo reúne información estratégica sobre microorganismos catalogados por la OMS como de “prioridad crítica”.
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Científicos crean en Brasil el primer banco de datos genómicos de bacterias multirresistentes
Con el objetivo de contribuir al monitoreo y el control de bacterias multirresistentes, investigadores de la Universidad de São Paulo (USP), en Brasil, crearon junto a otros colaboradores la plataforma One Health Brazilian Resistance (OneBR), que reúne datos epidemiológicos y fenotípicos, e información genómica referente a microorganismos catalogados por la Organización Mundial de Salud (OMS) como de prioridad.
Hasta ahora, el banco cuenta con datos de aproximadamente 500 patógenos humanos, y otros 200 se les agregarán en poco tiempo más. Esta iniciativa cuenta con el apoyo de la FAPESP, del Consejo Nacional de Desarrollo Científico y Tecnológico (CNPq) de Brasil y de la Fundación Bill y Melinda Gates.
“La plataforma no se restringe a las bacterias que infectan a los seres humanos. Es una iniciativa que comprende también al área veterinaria, es decir, a los agentes infecciosos de animales de cría o domésticos; y también la microbiología ambiental y de los alimentos. Nos basamos en el concepto de One Health (una salud o salud única, que plantea la interconexión entre la salud humana, la de los animales y la del ambiente que los rodea)”, dice Nilton Lincopan, docente del Instituto de Ciencias Biomédicas (ICB-USP) y coordinador del proyecto.
Otra perspectiva del grupo consiste en incluir datos recabados por pares latinoamericanos. “Estamos conversando con investigadores de Chile, Argentina, Uruguay y Ecuador, entre otros. Sería más interesante monitorear a las bacterias a nivel continental, pues existe una gran circulación de personas y de animales entre los países. Esta plataforma es como el lego. Construimos la base y, a partir de ella, las posibilidades son infinitas”, afirma Lincopan.
El acceso al material es gratuito y online, y no requiere registrarse o solicitar autorización. Basta con ingresar al sitio web y navegar. La información disponible abarca el lugar donde se aisló al patógeno, datos clínicos del paciente, datos epidemiológicos y la secuencia completa del genoma bacteriano, con relieve para los principales genes de resistencia y virulencia, una información que pueden ayudarle al médico a elegir un antibiótico eficaz.
“Supongamos que se detecta la presencia de una bacteria multirresistente en un paciente de Recife (una metrópolis brasileña ubicada a más de 2000 kilómetros de São Paulo). El profesional de la salud busca en la plataforma y descubre que ese mismo clon fue aislado en un hospital de São Paulo un año antes. Podrá entonces preguntar si el paciente estuvo internado en ese hospital y, de ser ese el caso, avisarle a la institución sobre la propagación y el posible origen del patógeno”, ejemplifica el investigador.
La inteligencia de datos existente en la plataforma puede serles de utilidad no solamente a los médicos y a los equipos de control sanitario, sino también a veterinarios, biólogos, ingenieros ambientales e investigadores vinculados al área de biotecnología, según afirma Lincopan.
“Es posible buscar marcadores moleculares que permitan el desarrollo de kits de diagnóstico, por ejemplo. Otra aplicación que estamos explorando, con colegas del área de inteligencia artificial, consiste en la automatización del antibiograma con base en los datos genómicos”, comenta el investigador.
