Desarrollan herramienta para investigar la complejidad del genoma
Frente a los análisis cortos, el nuevo método obtiene información 100 veces más extensa.
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Desarrollan herramienta para investigar la complejidad del genoma
Las características de un organismo emergen de su genoma, una suerte de libro con las instrucciones del ADN y difícil de leer para la ciencia.
En este campo, investigadores de España publicaron en la revista Nature Methods una mejora de un programa informático, capaz de descubrir nuevas moléculas de ARN mediante herramientas de lectura más largas.
Frente a los análisis cortos, que analizan 200 nucleótidos (las letras de los genes), el método actual obtiene información 100 veces más extensa.
Según los expertos, el software asigna datos para el nuevo tránscrito, “algo esencial al entender la complejidad de cada cuerpo y de las enfermedades”.
Para desarrollar este programa informático usaron el clúster de computación Garnatxa del I2SysBio, que dispone de 15 nodos de computación.
Además, utilizaron datos del Foto Estratégico Europeo que permite a laboratorios de ciencias de la vida de toda la región compartir y almacenar sus resultados.
El empleo del nuevo proyecto es libre en los sistemas comerciales Pacific Biosciences y Oxford Nanopore Technologies.
Unos años antes, en 2018, la investigadora Ana Conesa, entonces en la Universidad de Florida, desarrolló por primera vez esa herramienta.
La lectura larga reconstruye mejor la complejidad de cada ser humano y es clave para estudiar enfermedades, sobre todo de tipo neurológico y en el cáncer.
